Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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