Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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UBE3CQ15386 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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