Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK2Q15119 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms