Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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