Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms