Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
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