Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RASGRF1Q13972 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms