Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PKP1Q13835 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PKP1Q13835 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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