Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
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SHROOM2Q13796 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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SHROOM2Q13796 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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SHROOM2Q13796 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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SHROOM2Q13796 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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SHROOM2Q13796 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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SHROOM2Q13796 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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SHROOM2Q13796 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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