Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms