Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CUL1Q13616 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CUL1Q13616 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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CUL1Q13616 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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