Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms