Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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