Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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