Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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