Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms