Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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