Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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