Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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