Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FOXC1Q12948 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FOXC1Q12948 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FOXC1Q12948 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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