Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRJQ12913 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRJQ12913 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PTPRJQ12913 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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