Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TROQ12816 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TROQ12816 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TROQ12816 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms