Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TFCP2Q12800 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms