Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms