Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms