Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD47Q08722 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms