Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms