Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms