Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms