Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms