Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms