Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms