Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX1P78337 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX1P78337 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX1P78337 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX1P78337 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX1P78337 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX1P78337 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX1P78337 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX1P78337 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.5 ms