Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO4P61968 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO4P61968 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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