Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms