Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TMEM258P61165 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TMEM258P61165 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TMEM258P61165 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TMEM258P61165 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TMEM258P61165 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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