Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB15P59190 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB15P59190 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB15P59190 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB15P59190 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB15P59190 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB15P59190 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB15P59190 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms