Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00313P59037 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms