Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OXCT1P55809 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OXCT1P55809 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms