Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA8P53708 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms