Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB5CP51148 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB5CP51148 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB5CP51148 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB5CP51148 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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