Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM4P49221 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM4P49221 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms