Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms