Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms