Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms