Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPB2P35606 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms