Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms