Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms