Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms