Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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